Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc84Q4VA36 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc84Q4VA36 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms