Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap2Q3V1H1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms