Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp48Q3V0C5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms