Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnpc3Q3UZ01 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnpc3Q3UZ01 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnpc3Q3UZ01 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms