Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clpsl2Q3UW21 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms