Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fcho2Q3UQN2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcho2Q3UQN2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms