Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3UPC7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3UPC7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3UPC7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3UPC7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UPC7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UPC7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UPC7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3UPC7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms