Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms