Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms