Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrxosQ3UL53 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms