Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ell2Q3UKU1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ell2Q3UKU1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ell2Q3UKU1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms