Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp19Q3UJD6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp19Q3UJD6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms