Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Parp8Q3UD82 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms