Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KhsrpQ3U0V1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KhsrpQ3U0V1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms