Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms