Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms