Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla6Q3TRM4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla6Q3TRM4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms