Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TQQ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms