Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2cQ3TLH4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2cQ3TLH4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2cQ3TLH4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms