Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms