Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stt3bQ3TDQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stt3bQ3TDQ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms