Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd8Q3TA59 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms