Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pi4k2aQ2TBE6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pi4k2aQ2TBE6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms