Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vax1Q2NKI2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax1Q2NKI2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms