Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rpusd3Q14AI6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rpusd3Q14AI6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rpusd3Q14AI6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd3Q14AI6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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