Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VgfQ0VGU4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VgfQ0VGU4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms