Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata18Q0P557 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spata18Q0P557 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spata18Q0P557 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms