Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm1Q0GA42 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm1Q0GA42 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm1Q0GA42 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms