Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncf1Q09014 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncf1Q09014 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncf1Q09014 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms