Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
1700061G19RikQ08EE8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms