Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cass4Q08EC4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms