Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp2Q08652 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp2Q08652 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp2Q08652 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms