Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col9a2Q07643 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col9a2Q07643 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms