Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah1bQ06985 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms