Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms