Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms