Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk16Q04735 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms