Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms