Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcqQ02111 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcqQ02111 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms