Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms