Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga4Q00651 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga4Q00651 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms