Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tcf7Q00417 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms