Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp9bP98195 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp9bP98195 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms