Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shc1P98083 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shc1P98083 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shc1P98083 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shc1P98083 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shc1P98083 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms