Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AlkP97793 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AlkP97793 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AlkP97793 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AlkP97793 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AlkP97793 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AlkP97793 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AlkP97793 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
AlkP97793 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AlkP97793 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AlkP97793 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AlkP97793 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AlkP97793 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AlkP97793 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AlkP97793 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AlkP97793 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AlkP97793 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AlkP97793 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AlkP97793 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AlkP97793 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AlkP97793 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AlkP97793 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AlkP97793 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AlkP97793 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlkP97793 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AlkP97793 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AlkP97793 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AlkP97793 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AlkP97793 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AlkP97793 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AlkP97793 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
AlkP97793 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AlkP97793 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AlkP97793 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AlkP97793 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AlkP97793 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AlkP97793 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AlkP97793 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AlkP97793 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AlkP97793 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AlkP97793 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AlkP97793 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AlkP97793 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AlkP97793 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AlkP97793 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AlkP97793 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AlkP97793 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AlkP97793 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AlkP97793 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AlkP97793 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AlkP97793 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AlkP97793 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AlkP97793 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AlkP97793 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AlkP97793 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AlkP97793 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AlkP97793 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AlkP97793 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AlkP97793 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AlkP97793 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AlkP97793 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms