Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LystP97412 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LystP97412 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LystP97412 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LystP97412 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LystP97412 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LystP97412 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LystP97412 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LystP97412 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LystP97412 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LystP97412 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LystP97412 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LystP97412 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LystP97412 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms