Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp1P97309 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mesp1P97309 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms