Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H3f3aP84244 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H3f3aP84244 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms