Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubg1P83887 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms