Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms